احمد مروی، تولیت آستان قدس رضوی گفت: «با نظر مجتبی خامنهای، محل دفن جنازه علی خامنهای، در مسیر زائران محل دفن امام هشتم شیعیان در مشهد خواهد بود.»
مروی اعلام کرد به مجتبی خامنهای پیشنهاد شده بود تا جایی شبیه محل دفن شیخ بهایی برای خامنهای ساخته شود «تا بهتدریج ماندگار شود»، اما او با این موضوع مخالفت کرده است.
تولیت آستان قدس رضوی همچنین افزود اختیار تعیین مکان دفن جنازه علی خامنهای با «بیت رهبری» است و هر کجا که تعیین شود، آنجا انجام خواهد شد.