علی شیرازی، عضو تحریریه ایراناینترنشنال، درباره «نظر متفاوت» مجتبی خامنهای نسبت به یادداشت تفاهم گفت: «در حالی که مسعود پزشکیان عملا نقشی در این معادله ندارد، مجتبی خامنهای نیز مانند پدرش که پس از توافق برجام، مسئولیت را متوجه محمدجواد ظریف و حسن روحانی کرد، از پذیرش مسئولیت خودداری کرده و آن را بر عهده پزشکیان و اعضای شورای عالی امنیت ملی گذاشته است.»